Impact des ions sur l'intégrité cellulaire et le métabolisme à travers l'arbre du vivant

Contexte scientifique

L'un des dogmes centraux de la bioénergétique postule que la traduction des protéines, l'un des processus les plus énergivores des systèmes vivants, nécessite un transport actif des nutriments et une membrane cellulaire énergisée, principalement régulée par les ions. Des résultats récents obtenus par notre équipe mettent en lumière le rôle crucial des ions dans la traduction protéique et le maintien de l'intégrité cellulaire chez les archées, les bactéries et les eucaryotes.

Objectifs du projet et méthodologie

L'objectif de ce projet est de quantifier et de caractériser les mécanismes physiques et biochimiques fondamentaux régissant l'influence des ions sur la production de protéines et l'intégrité cellulaire. Le ou la candidat(e) évaluera la synthèse protéique ainsi que la survie en milieu dépourvu de nutriments en utilisant des organismes modèles issus des trois domaines du vivant (archées, bactéries, levures).

Les principaux axes méthodologiques sont les suivants :

• Isolement et culture de modèles : extraction et manipulation de systèmes modèles dans des conditions expérimentales contrôlées.
• Essais cinétiques multi-échelles : mesure de la dynamique d'expression à long terme à l'aide de lecteurs de microplaques à fluorescence et de microscopie optique/à fluorescence à l'échelle de la cellule unique (single-cell).
• Analyse quantitative des données : développement de flux de travail (workflows) légers sous Python pour l'ajustement de courbes cinétiques et le phénotypage.

Profil recherché et perspectives

Nous recherchons un(e) étudiant(e) motivé(e) en Master 2 (M2) en biophysique, biochimie, biologie, bio-ingénierie ou biologie quantitative. L'anglais est la langue de travail principale au sein du laboratoire. Ce projet exploratoire offre un fort potentiel de poursuite en thèse de doctorat (sous réserve de l'obtention d'un financement via concours doctoral ou bourse de recherche).